辣椒（Capsicum annuum L.）是一种在全球范围内广泛种植的蔬菜和香料作物。近日，中国农科院蔬菜花卉研究所王立浩团队通过多组学表征了南方四省辣椒代谢品质特征。相关结果以Characterization of metabolites and Transcriptome of Pepper Accessions from Four Southern Provinces of China发表在MDPI Genes。

本研究旨在揭示来自不同地区的辣椒品种间的代谢物差异，并探索与辣椒代谢物相关的候选基因。通过广泛靶向代谢组学分析和RNA测序技术，测定了36个辣椒品种的代谢组和转录组数据，并分析了来自中国四个重要辣椒生产和消费省份（湖南、贵州、云南和四川）的C. annuum的差异代谢物和差异基因。结果表明，类黄酮是区分“云贵川组”和“湖南组”辣椒品种的主要特征代谢物。每个组中特征类黄酮的苷元不同；在“云贵川组”中主要为木犀草素、槲皮素、金黄异黄酮和异鼠李素；在“湖南组”中主要为芹菜素。转录组数据显示，两组辣椒间有两个与类黄酮3'-单加氧酶相关的基因显著差异，推测它们可能是调控类黄酮的核心酶。同时，在基因Cgla06g001871上发现的一个SNP突变与“云贵川组”辣椒品种有很强的相关性，能作为鉴别“云贵川组”辣椒品种的DNA标记，为地方特色品种保护提供有力支持。此外，还分析了四个省份辣椒品种中与味道和营养相关的代谢物，结果显示，贵州的辣椒品种糖含量低，四川的辣椒品种辣椒素含量低，而四个省份辣椒品种的酸和维生素含量无显著差异。