水利部农业节水重点实验室是深入贯彻落实“节水优先”和“农业节水化”战略的必然要求，是保障国家粮食安全和灌区可持续发展的迫切需要，是水利部系统外单位的第一个重点实验室。水利部农业节水重点实验室将围绕国家、行业重大战略需求及水利中心工作需要，聚焦农业节水化政策与战略、农业高效用水定额与标准、灌区多水源利用与智慧管理、灌区输配水系统安全与节能、农业高效节水技术与装备等领域，全面开展科研攻关，提高创新能力与科研水平，切实促进水利改革发展。

水利部重点实验室是水利科技创新体系的重要组成部分，是水利行业的战略科技力量。本次共有5个重点实验室获批筹建，其他4个为“水利部太湖流域水治理重点实验室”、“水利部长江治理与保护重点实验室”、“水利部黄河流域水治理与水安全重点实验室”、“水利部水利大数据重点实验室”。