在逐步淘汰甲基溴之后，采用了其他化学品进行土壤消毒。我国颜冬冬博士报告称，甲基溴目前已被以下物质大量取代：超甲基钠/钾、磺酰氟、二甲基二硫、异硫氰酸烯丙酯等。这些药剂在中国已经发展出许多应用方法，包括直接注入、化学灌溉、热气应用和旋耕机机械整合土壤。土壤熏蒸在温室和露天田园产生了显著的积极影响，包括生产出更旺盛的植物、更大更绿的叶子和显著更高的产量。

但他表明，除了熏蒸剂的杀虫作用外，它们还抑制了微生物的硝化活性，从而从根本上减少了氮的浸出损失。这种现象在实验室和种植现场都很明显。熏蒸还刺激氮矿化过程，通过有机含氮化合物的降解将铵释放到土壤中。因此，化学土壤熏蒸增加了土壤的氮有效性，这得益于硝化作用的抑制和氮矿化的促进。我国研究人员的其他报告表明，化学熏蒸可以提高植物对其他土壤养分的利用率。

土壤日晒、土壤淹水和土壤蒸制是典型的物理做法，比化学做法更环保却又十分高效。土壤日光化是在高太阳辐射强烈的季节利用太阳能来提高土壤温度，以杀灭或严重削弱土壤传播的植物病原体。它是通过用防水布覆盖潮湿的土壤来进行的，防水布通常是一种不透水、不透气的塑料覆盖物，可以吸收太阳能，并将其保持在处理过的地块内30-50天，随后可以将其移除。含水量支持太阳热对流到处理过的土壤的深层。它可以单独用水，也可以与化学品或有机材料结合使用。目前，西班牙东南部90%以上的农场都在使用太阳能。

据报道，生物消毒方法使用以下有机改良剂：新鲜辣椒和黄瓜植物残渣、新鲜和半堆肥羊粪、小麦壳、向日葵颗粒。根据循环经济的原则，通过生物消毒将新鲜植物残渣应用于土壤中，作为作物残留物管理的一种替代方案。通过控制植物病原体来开发抑制性土壤也可以通过用以下改良剂来实现：绿色堆肥和生物控制剂（木霉属、解淀粉芽孢杆菌、假单胞菌属）、黑蝇幼虫的粪便、商业几丁质、向日葵籽壳、麦麸、啤酒渣和油菜籽饼。